Atalgojuma politika saistoša visiem Pārvaldes darbiniekiem.
Šo politiku nepiemēro Pārvaldes valdes locekļu atlīdzības noteikšanai.
Valdes locekļu atlīdzību nosaka Ministru kabineta 2010. gada 10. augusta noteikumi Nr.741,"Noteikumi par ostas valdes locekļu mēnešalgu un speciālo piemaksu".

Atalgojuma politikas pamatprincipi:

• veicināt darbinieku profesionālo pieredzi, kvalifikācijas uzturēšanu, paaugstināšanu;
• veicināt ilgtermiņa darba tiesiskās attiecības un lojalitāti;
• nodrošināt atalgojuma sistēmas atbilstību Pārvaldes interesēm un attīstības stratēģijā noteiktajiem mērķiem;
• nodrošināt taisnīguma un vienlīdzības principus, kas paredz vienlīdzīgu samaksu par vienādas vērtības darbu;
• nodrošināt darbiniekiem stabilu, laikus izmaksātu un konkurētspējīgu darbinieku darba samaksu ar sociālajām garantijām.

Pārvaldes atalgojuma struktūru veido:

• atalgojuma nemainīgā daļa;
• atalgojuma mainīgā daļa;

Atalgojuma nemainīgo daļu veido: (mēneša darba alga vai stundas tarifa likme).

To nosaka diferencēti, atkarībā no amata pamatfunkcijas iedalījuma, ieņemamā amata un kvalifikācijas līmeņa, atbilstoši darba saturam un specifikai, apjomam, atbildības pakāpei un  darba tirgus atalgojuma tendencēm.

Atalgojuma nemainīgā daļa amatiem tiek noteikta ar valdes lēmumu apstiprinātajā amatu sarakstā, apstiprinot ikgadējo Pārvaldes budžetu.

Atalgojuma nemainīgā daļa var  tikt palielināta ņemot vērā Centrālās statistikas mājas lapā publicēto informāciju par inflācijas (patēriņa cenu izmaiņas) pieaugumu salīdzinot ar iepriekšējo gadu.

Atalgojuma sistēmas mainīgo daļu veido:

• piemaksas, kuras nosaka, pamatojoties uz Darba likumu un Pārvaldes iekšējiem normatīvajiem aktiem;
• prēmijas, kuras nosaka, atbilstoši noteiktā laika periodā sasniegtajiem darba rezultātiem un darbinieka attieksmei pret pienākumu izpildi, pamatojoties uz Pārvaldes iekšējiem normatīvajiem aktiem un saskaņā ar apstiprināto Pārvaldes budžetu kārtējā gadā;
• pabalsti un naudas balvas kurus nosaka, pamatojoties uz Darba likumu, Koplīgumu un Pārvaldes iekšējiem normatīvajiem aktiem.

Atalgojuma mainīgā daļa tiek apstiprināta ar valdes lēmumumiem, apstiprinot Pārvaldes kārtējo budžetu.

Saskaņā ar Valsts un pašvaldību institūciju amatpersonu un darbinieku atlīdzības likuma 3. panta 11. daļā un Ministru kabineta 2016. gada 12. aprīļa noteikumos Nr.225 „Kārtība, kādā tiek publiskota informācija par amatpersonu (darbinieku) atlīdzības noteikšanas kritērijiem un darba samaksas apmēru sadalījumā pa amatu grupām” noteiktajām prasībām Pārvaldē ir noteikts šāds darba samaksas apmēru sadalījums (sk.zemāk) un ir iespējamas šādas piemaksas, prēmijas, naudas balvas (sk.zemāk) un sociālās garantijas (sk.zemāk).